我院设党政管理机构包括（14个）：党委（院长）办公室、组织人事部（挂党委统战部、党委教师工作部牌子）、宣传部、学生工作处（挂武装部牌子）、财务处、招生就业处、教务处、科研处（挂科学研究所牌子）、发展规划处（挂政策研究处牌子）、总务处（挂基建处牌子）、产教融合处（挂校企合作处牌子）、治安保卫处（挂社会治安综合治理办公室牌子）、审计处、质量管理处。教学机构包括（15个）：成人教育学院（挂培训处、滨州开放大学牌子）、国际学院（挂国际交流与合作处牌子）、人文学院（挂基础课教学部牌子）、马克思主义学院（挂社会科学部牌子）、教育学院、生物工程学院、机电工程学院、化工与能源学院、健康学院、医学技术学院、经济管理学院（挂知识产权学院牌子）、创新创业学院、信息工程学院、建筑工程学院、军士学院（挂海洋学院、滨州双拥学院牌子）。教辅机构包括（2个）：图书馆、现代教育中心。科研机构包括（2个）：应用科技研究院、“心安城市”研究中心。群团组织包括（2个）：工会、团委。纪检监察机构（1个）：纪委。